Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5BQ9UGL1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
KDM5BQ9UGL1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms