Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX1-2Q9UD57 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms