Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC6Q9UBN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms