Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms