Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ORC3Q9UBD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ORC3Q9UBD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms