Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFIP11Q9UBB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFIP11Q9UBB9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms