Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4Q9P0V3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms