Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2L1Q9P0L9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms