Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L2Q9NZM6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms