Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSD3Q9NYI0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms