Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX43Q9NXZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX43Q9NXZ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms