Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD4Q9NXE4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD4Q9NXE4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.9 ms