Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB20Q9NX57 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB20Q9NX57 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB20Q9NX57 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms