Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMLHEQ9NVH6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMLHEQ9NVH6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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