Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L1Q9NU39 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms