Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC4Q9NTJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC4Q9NTJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC4Q9NTJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMC4Q9NTJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC4Q9NTJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMC4Q9NTJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms