Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3GQ9NS98 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms