Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF19Q9NS68 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF19Q9NS68 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms