Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP2Q9NS61 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms