Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX1Q9NRD9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms