Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO6Q9NRD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO6Q9NRD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO6Q9NRD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms