Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO8Q9NRD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO8Q9NRD0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms