Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST12Q9NRB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms