Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPHK2Q9NRA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms