Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR8Q9NR97 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms