Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIT2Q9NQR4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms