Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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