Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRTAC1Q9NQ79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAC1Q9NQ79 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRTAC1Q9NQ79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms