Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PREBQ9HCU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PREBQ9HCU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms