Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYP4F12Q9HCS2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F12Q9HCS2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms