Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms