Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRDE2Q9H7Z3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms