Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A3Q9H7F0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms