Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms