Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD4Q9H223 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD4Q9H223 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD4Q9H223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms