Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP44Q9H0E7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP44Q9H0E7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP44Q9H0E7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms