Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD7BQ9C0I4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD7BQ9C0I4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms