Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZC3H12CQ9C0D7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZC3H12CQ9C0D7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms