Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM5Q9C035 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms