Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM6Q9C030 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms