Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFIH1Q9BYX4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFIH1Q9BYX4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms