Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPL13Q9BYD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPL13Q9BYD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms