Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD1Q9BXT4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms