Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SALL3Q9BXA9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL3Q9BXA9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL3Q9BXA9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms