Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
JAM3Q9BX67 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
JAM3Q9BX67 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
JAM3Q9BX67 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JAM3Q9BX67 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
JAM3Q9BX67 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JAM3Q9BX67 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms