Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSM14BQ9BX40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM14BQ9BX40 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms