Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFAF3Q9BU61 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.3 ms