Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDFIP1Q9BT67 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms