Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00467Q9BRT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms