Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOXF2Q9BQY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms